Kaupunki-innovaatioihin liittyy myös vuoden 2011 alussa käynnistynyt 1,5-vuotinen CityInnoNets-tutkimushanke, jota vetää Aalto-yliopiston kauppakorkeakoulu.
CityInnoNets (CIN) –projekti tutkii arvoverkostojen muodostamista ja niiden hyödyntämistä kaupunki-innovaatioiden leviämisessä. CIN-projekti yhdessä Kaupunki-innovaatiot –kokonaisuuden kanssa muodostavat kontekstisidonnaisen, yritysten arvonmuodostukseen liittyvän käyttäjälähtöisen kehitysympäristön, living labin. CityInnoNets-hankkeen muodostamaan yritysjoukkoon on haettu yrityksiä ja organisaatioita asumisen, rakentamisen, palvelujen ja liikenteen toimialoilta.
CIN -projektin tavoitteena on kaupunki-innovaatioiden ja siihen kytkeytyvien yritysten ja organisaatioiden arvoverkoston rakenteen analyysi, innovaation skaalautuvuuteen vaikuttavien tekijöiden tunnistaminen ja mallintaminen sekä alustava kaupunki-innovaatioiden kysynnän ja tarjonnan jäsentäminen. Tutkimuksen empiirinen osio toteutetaan haastattelemalla asiantuntijoita ja yritysten edustajia sekä keräämällä etnografista aineistoa projektin eri vaiheissa järjestettävissä työpajoissa ja seminaareissa. CIN-projekti osana Kaupunki-innovaatiot -hanketta pyrkii tukemaan käytäntö- ja käyttäjälähtöisen toimintamallin rakentamista ja toteuttamista sekä luomaan rajapintaa kansainväliseen innovaatio- ja arvoverkkotutkimukseen. Projekti tuottaa uutta tietoa ja ymmärrystä yhteiskunnallisella, verkosto-, sekä yritystasolla.